Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn2bQ0KL01 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms