Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Znf541Q0GGX2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms