Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssrp1Q08943 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms