Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp2Q08652 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp2Q08652 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp2Q08652 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp2Q08652 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp2Q08652 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp2Q08652 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp2Q08652 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp2Q08652 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp2Q08652 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbp2Q08652 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbp2Q08652 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms