Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgm3Q08189 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgm3Q08189 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms