Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col9a2Q07643 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms