Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cxcr5Q04683 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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