Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tff2Q03404 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tff2Q03404 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms