Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mmp11Q02853 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms