Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nucb1Q02819 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nucb1Q02819 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms