Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nhlh1Q02576 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms