Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VcpQ01853 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms