Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mc1rQ01727 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms