Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp1Q01514 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms