Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Top2aQ01320 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Top2aQ01320 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms