Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms