Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

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Length 53 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms