Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csf2raQ00941 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms