Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cds1P98191 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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