Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IhhP97812 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IhhP97812 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IhhP97812 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IhhP97812 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IhhP97812 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IhhP97812 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IhhP97812 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IhhP97812 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IhhP97812 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IhhP97812 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IhhP97812 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IhhP97812 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IhhP97812 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
IhhP97812 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IhhP97812 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IhhP97812 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IhhP97812 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IhhP97812 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IhhP97812 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IhhP97812 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IhhP97812 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms