Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bop1P97452 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms