Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrkdcP97313 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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