Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43bP86448 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim43bP86448 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms