Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc8a1P70414 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc8a1P70414 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms