Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxb13P70321 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms