Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54lP70270 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms