Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn5P68500 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms