Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UbdP63072 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UbdP63072 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UbdP63072 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UbdP63072 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms