Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2lP62876 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms