Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl18aP62717 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms