Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpd1P62315 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms