Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tdrd6P61407 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd6P61407 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms