Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2kP61087 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms