Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sem1P60897 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sem1P60897 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sem1P60897 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sem1P60897 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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