Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gp1bbP56400 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms