Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Faf1P54731 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Faf1P54731 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Faf1P54731 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Faf1P54731 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Faf1P54731 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Faf1P54731 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Faf1P54731 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Faf1P54731 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Faf1P54731 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Faf1P54731 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Faf1P54731 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Faf1P54731 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Faf1P54731 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Faf1P54731 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms