Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RabggtbP53612 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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