Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2e3P52483 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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