Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa-rs12P50716 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms