Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SftpbP50405 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SftpbP50405 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpbP50405 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms