Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SftpdP50404 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms