Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LtbrP50284 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LtbrP50284 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LtbrP50284 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms