Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VdrP48281 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VdrP48281 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VdrP48281 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VdrP48281 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VdrP48281 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms