Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgavP43406 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgavP43406 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.5 ms