Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elk3P41971 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk3P41971 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms