Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl28P41105 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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