Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms