Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd9P40240 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd9P40240 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd9P40240 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms