Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cap1P40124 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms