Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms